Effects of simulated warming on bacterial diversity and abundance in tropical soils from East Malaysia using open top chambers

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Date: Jan. 2021
From: Canadian Journal of Microbiology(Vol. 67, Issue 1)
Publisher: NRC Research Press
Document Type: Report
Length: 5,182 words
Lexile Measure: 1520L

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Abstract :

The effects of global warming are increasingly evident, where global surface temperatures and atmospheric concentration of carbon dioxide have increased in past decades. Given the role of terrestrial bacteria in various ecological functions, it is important to understand how terrestrial bacteria would respond towards higher environmental temperatures. This study aims to determine soil bacterial diversity in the tropics and their response towards in situ warming using an open-top chamber (OTC). OTCs were set up in areas exposed to sunlight throughout the year in the tropical region in Malaysia. Soil samples were collected every 3 months to monitor changes in bacterial diversity using V3-V416S rDNA amplicon sequencing inside the OTCs (treatment plots) and outside the OTCs (control plots). After 12 months of simulated warming, an average increase of 0.81 to 1.15 [degrees]C was recorded in treatment plots. Significant changes in the relative abundance of bacterial phyla such as Bacteroidetes and Chloroflexi were reported. Increases in the relative abundance of Actinobacteria were also observed in treatment plots after 12 months. Substantial changes were observed at the genus level, where most bacterial genera decreased in relative abundance after 12 months. This study demonstrated that warming can alter soil bacteria in tropical soils from Kota Kinabalu. Key words: Kota Kinabalu, soil bacterial diversity, in situ warming, 16S rDNA. Les effets du rechauffement climatique sont de plus en plus evidents, la ou les temperatures globales de surface et la concentration atmospherique de dioxyde de carbone ont augmente au cours des dernieres decennies. Compte tenu du role exerce par les bacteries terrestres dans diverses fonctions ecologiques, il est important de comprendre comment les bacteries terrestres reagiraient a des temperatures environnementales plus elevees. Cette etude vise a determiner la diversite des bacteries du sol dans les tropiques et leur reaction au rechauffement in situ a l'aide d'enceintes a ciel ouvert (ECO). Les ECO ont ete installees dans des zones exposees au soleil toute l'annee dans la region tropicale de Malaisie. Des echantillons de sol ont ete recoltes tous les 3 mois afin de suivre les changements de la diversite bacterienne en utilisant le sequencage de l'amplicon V3-V4 de l'ADNr 16S a l'interieur des ECO (parcelles traitees) et a l'exterieur des ECO (parcelles controle). Apres 12 mois de rechauffement simule, une augmentation moyenne de 0,81 a 1,15 [degrees]C a ete enregistree dans les parcelles traitees. Des changements significatifs de l'abondance relative des phylums bacteriens tels que les Bacteroidetes et les Chloroflexi ont ete signales. Des augmentations de l'abondance relative des Actinobacteria ont egalement ete observees dans les parcelles traitees apres 12 mois. Des changements substantiels ont ete observes au niveau du genre, ou l'abondance relative de la plupart des genres bacteriens a diminue apres 12 mois. Cette etude a demontre que le rechauffement peut modifier les bacteries du sol dans les sols tropicaux de Kota Kinabalu. [Traduit par la Redaction] Mots-cles : Kota Kinabalu, diversite bacterienne du sol, rechauffement in situ, ADNr 16S.

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Gale Document Number: GALE|A648001926