Fungal endophyte diversity in table grapes

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Authors: Champa Wijekoon and Zoe Quill
Date: Jan. 2021
From: Canadian Journal of Microbiology(Vol. 67, Issue 1)
Publisher: NRC Research Press
Document Type: Report
Length: 4,868 words
Lexile Measure: 1440L

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Abstract :

Plant fungal endophytes are diverse microbial sources that reside inside plants. Grapes (Vitis vinifera) are rich in polyphenols that have beneficial health effects, and recent research has shown that fungal endophytes in grapes may contribute to the production of these polyphenols and may serve as biocontrol agents. In this study, we determined the fungal microbial endophyte diversity in North American table grapes found at a Winnipeg, Manitoba, market. The amplicon internal transcribed spacer (ITS) metagenomics approach was used to profile the fungal communities of the fruit endophyte microbiome of three table grape types. The data supported endophyte diversity in different table grapes, including possible bioactive, saprophytic, and pathogenic fungi. Culturable endophytes were isolated and identified by morphology and ITS amplicon sequencing. The majority of the isolated culturable strains included Alternaria spp. and Cladosporium spp. The results provided evidence of the existence of diverse fungal endophytes isolated and identified from the fruit of the table grapes. These fungal endophytes may have potential in agricultural, industrial, and pharmaceutical applications. Keywords: fungal endophytes, grapes, Alternaria spp., Cladosporium spp. Les endophytes fongiques des vegetaux consistent en sources microbiennes diverses qui resident a l'interieur des plantes. Les raisins (Vitis vinifera) sont riches en polyphenols qui exercent des effets benefiques sur la sante, et des recherches recentes ont montre que les endophytes fongiques du raisin peuvent contribuer a la production de ces polyphenols et servir d'agents de biocontrole. Dans cette etude, les auteurs ont determine la diversite des endophytes microbiens fongiques des raisins de table nord-americains trouves sur le marche a Winnipeg. L'approche en metagenomique des amplicons de l'espaceur interne transcrit (ITS ) a ete utilisee pour etablir le profil des communautes fongiques du microbiome endophyte de trois types de raisins de table. Les donnees ont confirme la diversite des endophytes dans les differents raisins de table, y compris des champignons bioactifs, saprophytes et pathogenes. Les endophytes cultivables ont ete isoles et identifies par leur morphologie et par sequencage des amplicons de l'ITS. La majorite des souches cultivables isolees comprenaient Alternaria spp. et Cladosporium spp. Les resultats ont fourni la preuve de l'existence de divers endophytes fongiques isoles et identifies a partir des raisins de table. Ces endophytes fongiques peuvent avoir un potentiel dans les applications agricoles, industrielles et pharmaceutiques. [Traduit par la Redaction] Mots-cles : endophytes fongiques, raisins, Alternaria spp., Cladosporium spp.

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Gale Document Number: GALE|A648001923