Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for rapid detection of viable but non-culturable Vibrio cholerae O1.

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Date: Feb. 2022
From: Canadian Journal of Microbiology(Vol. 68, Issue 2)
Publisher: NRC Research Press
Document Type: Article
Length: 5,340 words
Lexile Measure: 1490L

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Abstract :

Vibrio cholerae, an important waterborne pathogen, is a rod-shaped bacterium that naturally exists in aquatic environments. When conditions are unfavorable for growth, the bacterium can undergo morphological and physiological changes to assume a coccoid morphology. This stage in its life cycle is referred to as viable but non-culturable (VBNC) because VBNC cells do not grow on conventional bacteriological culture media. The current study compared polymerase chain reaction (PCR) and loop-mediated isothermal amplification (LAMP) to detect and identify VBNC V. cholerae. Because it is difficult to detect and identify VBNC V. cholerae, the results of the current study are useful in showing that LAMP is more sensitive and rapid than PCR in detecting and identifying non-culturable, coccoid forms of V. cholerae. Furthermore, the LAMP method is effective in detecting and identifying very low numbers of coccoid VBNC V. cholerae in environmental water samples, with the added benefit of being inexpensive to perform. Key words: LAMP, PCR, Vibrio cholerae O1, VBNC, coccoid. Vibrio cholerae, un important organisme pathogene provenant de l'eau, est une bacterie en forme de batonnet qui existe naturellement dans les environnements aquatiques. Lorsque les conditions sont defavorables a sa croissance, la bacterie peut subir des changements morphologiques et physiologiques pour adopter une morphologie cocciforme. Ce stade de son cycle de vie est qualifie de viable mais non cultivable (VBNC), car les cellules VBNC ne se developpent pas sur des milieux de culture bacteriologique conventionnels. L'etude actuelle a compare la reaction en charne par polymerase (PCR) et l'amplification isotherme mediee par boucle (LAMP) pour detecter et identifier V. cholerae VBNC. Puisqu'il est difficile de detecter et d'identifier V. cholerae VBNC, les resultats de l'etude actuelle sont utiles, car ils montrent que la methode LAMP est plus sensible et rapide que la PCR pour detecter et identifier les formes cocciformes non cultivables de V. cholerae. En outre, la methode LAMP est efficace pour detecter et identifier de tres faibles nombres de V. cholerae VBNC cocciformes dans les echantillons environnementaux d'eau, avec l'avantage supplementaire d'etre peu couteuse a realiser. Mots-cles : LAMP, PCR, Vibrio cholerae O1, VBNC, cocciforme.

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Gale Document Number: GALE|A693514955