Identification of iron-responsive genes in Proteus vulgaris.

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Date: Nov. 2022
From: Canadian Journal of Microbiology(Vol. 68, Issue 11)
Publisher: NRC Research Press
Document Type: Report
Length: 4,507 words
Lexile Measure: 1490L

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Abstract :

Iron is essential for almost all bacteria, and iron homeostasis is precisely controlled by the ferric uptake regulator (Fur). The Fur regulons have been well characterized in some model bacteria, yet little is known in the common opportunistic pathogen Proteus vulgaris. In this study, Fur regulon and iron-responsive genes in P. vulgaris were mainly defined by in silico and proteomic analyses. The results showed that about 250 potential Fur-regulated operons including 14 transcriptional factors were predicted, while 559 proteins exhibited differential expression in response to iron deficiency, not all being directly regulated by Fur, such as transcriptional factors lexA, recA, narL, and arcA. Collectively, these results demonstrated that Fur functioned as a global regulatory protein to repress or activate expression of a large repertoire of genes in P. vulgaris; besides, not all the ironresponsive genes were directly regulated by Fur, whereas indirectly regulated through other mechanisms such as additional transcriptional regulatory proteins. Key words: iron, Fur regulon, virtual footprinting, proteomics, virulence factor Le fer est essentiel pour presque toutes les bacteries, et l'homeostasie du fer est precisement controlee par le regulateur d'absorption du fer (Fur). Les regulons Fur ont ete bien caracterises chez certaines bacteries modeles, mais on en sait peu sur l'agent pathogene opportuniste commun Proteus vulgaris. Dans cette etude, le regulon Fur et les genes repondant au fer chez P. vulgaris ont ete principalement definis par des analyses in silico et proteomiques. Les resultats ont montre qu'environ 250 operons potentiels regules par Fur, dont 14 facteurs de transcription, ont ete predits, tandis que 559 proteines presentaient une expression differentielle en reponse a la carence en fer, toutes n'etant pas directement regulees par Fur, comme les facteurs de transcription lexA, recA, narL et arcA. Dans l'ensemble, ces resultats ont demontre que Fur fonctionne comme une proteine regulatrice globale pour reprimer ou activer l'expression d'un large repertoire de genes chez P. vulgaris; en outre, tous les genes sensibles au fer n'etaient pas directement regules par Fur, mais indirectement par d'autres mecanismes tels que des proteines regulatrices transcriptionnelles supplementaires. [Traduit par la Redaction] Mots-cles : fer, regulon Fur, empreinte virtuelle, proteomique, facteur de virulence

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Gale Document Number: GALE|A727650461