Birds in a bush: toward an avian phylogenetic network/Aves en un arbusto: hacia una red filogenetica de las aves

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From: The Auk(Vol. 133, Issue 4)
Publisher: American Ornithologists' Union
Document Type: Author abstract; Report
Length: 478 words

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Abstract :

Reconstructing the avian tree of life has become one of the major goals in ornithology. The use of genomic tools seemed a promising approach to reach this goal, but, instead, phylogenetic analyses of large numbers of genes uncovered high levels of incongruence between the resulting gene trees. This incongruence can be caused by several biological processes, such as recombination, hybridization, and rapid speciation (which can lead to incomplete lineage sorting). These processes directly or indirectly amount to deviations from tree-like patterns, thereby thwarting the use of phylogenetic trees. Phylogenetic networks provide an ideal tool to deal with these difficulties. We illustrate the usefulness of phylogenetic networks to capture the complexity and subtleties of diversification processes by discussing several recent genomic analyses of birds in general and the well-known radiation of Darwin's finches. With the increasing amount of genomic data in avian phylogenetic studies, capturing the evolutionary history of a set of taxa in a phylogenetic tree will become increasingly difficult. Moreover, given the widespread occurrence of hybridization and the numerous adaptive radiations in birds, phylogenetic networks provide a powerful tool to display and analyse the evolutionary history of many bird groups. The genomic era might thus result in a paradigm shift in avian phylogenetics from trees to bushes. Keywords: phylogenetics, hybridization, phylogenetic networks, adaptive radiation, genomics Reconstruir el arbol de vida de las aves se ha convertido en uno de los mayores objetivos de la omitologia. El uso de herramientas genomicas parecia un enfoque promisorio para alcanzar este objetivo, pero en cambio los analisis filogeneticos de un gran numero de genes revelaron altos niveles de incongruencia entre los arboles geneticos resultantes. Esta incongruencia puede ser causada por varios procesos biologicos, como recombinacion, hibridacion y rapida especiacion (lo que puede llevar a la separacion incompleta de los linajes). Estos procesos directa o indirectamente conllevan a desviaciones de los patrones en forma de erbol, frustrando de este modo el uso de los arboles filogeneticos. Las redes filogeneticas representan una herramienta ideal para hacer frente a estas dificultades. Presentamos la utilidad de las redes filogeneticas para captar la complejidad y las sutilezas de los procesos de diversificacion mediante la discusion de varios analisis genomicos recientes de las aves en general y de la radiacion clasica de los pinzones de Darwin. Con el aumento de los datos genomicos en los estudios filogeneticos de las aves, sera aun mas dificil sintetizar la historia evolutiva de un grupo de taxa en un arbol filogenetico. Mas aun, dada la presencia generalizada de hibridacion y las numerosas radiaciones adaptativas en las aves, las redes filogeneticas brindan una herramienta poderosa para mostrar y analizar la historia evolutiva de muchos grupos de aves. Asi pues, la era genomica podria resultar en un cambio de paradigma en la filogenetica de las aves, de los arboles a los arbustos. Palabras clave: filogenetica, genomica, hibridacion, radiacion adaptativa, redes filogeneticas DOI: 10.1642/AUK-16-53.1

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Gale Document Number: GALE|A470867550